IL CONSORZIO SYNGO RILASCIA LA PRIMA CATALOGAZIONE ACCURATA DEI GENI CHE AGISCONO SULLE SINAPSI

IL CONSORZIO SYNGO RILASCIA LA PRIMA CATALOGAZIONE ACCURATA DEI GENI CHE AGISCONO SULLE SINAPSI

ROMA\ aise\ - Il consorzio di ricerca sul cervello riunisce le conoscenze scientifiche nei punti di connessione dei neuroni e, con un lavoro pubblicato sulla rivista Neuron, scopre nuove associazioni con le malattie. Carlo Sala e Chiara Verpelli, ricercatori dell’Istituto di neuroscienze del Cnr, sono membri del consorzio e autori della ricerca.
Le sinapsi, le giunzioni che servono come contatti specializzati tra le cellule nervose, sono le unità di elaborazione delle informazioni fondamentali del cervello. Una perdita di attività coordinata alla sinapsi è alla radice di molti disturbi cerebrali (chiamati collettivamente ‘sinaptopatie’).
Le fonti informatiche rigorose sulla sinapsi sono però attualmente carenti. Carlo Sala e Chiara Verpelli, ricercatori dell’Istituto di neuroscienze del Consiglio nazionale delle ricerche (Cnr-In), sono membri del consorzio SYNGO, che riunisce 15 laboratori in tutto il mondo e che, assieme al Consorzio Gene Ontology (GO), ha rilasciato la prima versione di una piattaforma (www.SYNGOportal.org) che mira a rappresentare le attuali conoscenze scientifiche della comunità delle neuroscienze circa l’architettura della sinapsi. Utilizzando strutture chiamate ontologie, SYNGO 1.0 ha rilasciato circa 3.000 descrizioni di oltre 1.100 geni sinaptici, riunendo informazioni sperimentali pubblicate sulla localizzazione e/o sulla funzione dei loro prodotti proteici. SYNGO è completamente integrato nella “knowledge base GO” (http://geneontology.org), la più grande fonte di informazioni al mondo sulle funzioni dei geni.
Sala e Verpelli, assieme ai membri del consorzio, hanno inoltre partecipato a un lavoro pubblicato sulla rivista Neuron dove, utilizzando SYNGO 1.0, hanno dimostrato che i geni sinaptici sono cambiati poco nel corso dell’evoluzione, sono cioè evolutivamente ben conservati, e che sono funzionalmente molto più sensibili, cioè meno tolleranti alle mutazioni, rispetto ad altri geni espressi nel cervello. Gli autori mostrano anche che le variazioni in molti geni sinaptici sono significativamente associate con l'intelligenza, il livello di istruzione, l'ADHD, l'autismo e il disturbo bipolare. Mutazioni associate a disturbi neuropsichiatrici sono inoltre molto più probabili rispetto ad altri geni espressi nel cervello.
La trasmissione dei segnali da una cellula nervosa all'altra è orchestrata da una vasta collezione di proteine ??situate sulle superfici dei neuroni su entrambi i lati di una sinapsi, codificate probabilmente da qualche migliaio di geni. Decenni di ricerche hanno fornito elenchi di proteine per diversi tipi di sinapsi, oltre a numerosi suggerimenti su come queste proteine ??interagiscono per guidare le funzioni sinaptiche. Tuttavia, alla comunità delle neuroscienze mancava una struttura o un modello di riferimento per rappresentare e descrivere questo corpo di informazioni. Il consorzio SYNGO si è riunito per iniziare a riempire questo vuoto e sintetizzare le conoscenze disponibili.
Il consorzio SYNGO è stato fondato nel 2015 da Steven Hyman e Guoping Feng dello Stanley Centre for Psychiatric Research presso l'Broad Institute of MIT di Cambridge (MA) e coordinato da Guus Smit e Matthijs Verhage del Center for Neurogenomics and Cognitive Research (CNCR) presso la VU University, Amsterdam, Paesi Bassi, e, per il Consorzio GO, Paul Thomas presso l'Università della California meridionale.
Lo Stanley Center ha esplorato le possibilità di formare un consorzio per generare un formato accettabile a livello mondiale per l'ontologia e l'annotazione della sinapsi. Guidato dal CNCR, dal consorzio GO e dallo Stanley Center, SYNGO si basa su precedenti iniziative generate nei consorzi di ricerca sinapsi europei (cioè EU-Synapse, EuroSpin, SynSys).
La prima attività di SYNGO è stata quella di collaborare con i principali opinion leader nel campo delle neuroscienze per costruire un consensus ontology, annotation e curation framework. Tuttavia, il database SYNGO si basa sulla partecipazione attiva e sui contributi delle conoscenze della comunità di biologia delle sinapsi. SYNGO può espandersi solo con l'aiuto di molti e, a tal fine, il consorzio ha sviluppato uno strumento di struttura aperta, trasparente, basato sul web - disponibile all'indirizzo [https://www.syngoportal.org] - per l'annotazione sinaptica con decisioni a priori minime in base alle quali chiunque nella comunità può aggiungere o modificare informazioni nella knowledge base. (aise) 

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